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| 名称 | 依托单位 | 级别 | 负责人 |
| 绿化树种国家林木种质资源库 | 林业所 | 李 斌 | |
| 滨海抗逆树种国家林木种质资源库 | 林业所 | 褚建民 | |
| 古巴加勒比松国家林木种质资源库 | 林业所 | 宗亦臣 | |
| 山茶、木兰国家林木种质资源库 | 亚林所 | 姜景民 | |
| 热带珍贵树种国家林木种质资源库 | 热林所 | 陈仁利 | |
| 热带与南亚热带珍贵树种国家林木种质资源库 | 热林中心 | 谌红辉 | |
| 亚热带林木国家林木种质资源库 | 亚林中心 | 刘 儒 | |
| 沙棘国家林木种质资源库 | 沙林中心 | 刘 芳 | |
| 华北地区代表性植物国家林木种质资源库 | 华林中心 | 孙敬爽 | |
| 北方主要名优经济树种国家林木种质资源库 | 泡桐中心 | 李芳东 |
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